本處隸屬於臺北市政府，為本府二級機關，置處長、副處長2位、主任秘書、專門委員2位。下設5科、5室以及12分處。5科包含企劃服務科、財產稅科、機會稅科、稅務管理科以及法務科；5室則分為資訊室、秘書室、會計室、人事室、政風室；12分處分別為中正分處、大同分處、中山分處、萬華分處、信義分處、松山分處、南港分處、文山分處、大安分處、士林分處、北投分處、內湖分處，組織架構圖如下：
處本部：包含處長、副處長2位、主任秘書、專門委員2位、秘書、助理稅務員、駕駛及技工。
本處各單位職掌如下：
一、企劃服務科：宣導、管制、服務。
二、財產稅科：地價稅及田賦、土地增值稅及工程受益費、房屋稅及契稅。
三、機會稅科：娛樂稅及印花稅、使用牌照稅。
四、稅務管理科：清理欠稅、欠稅執行、稅務管理。
五、法務科：行政救濟、查緝及違章審理等業務。
六、資訊室：徵課及管制、稅務系統、機器操作。
七、秘書室：文書檔案、事務、出納、採購。
八、會計室：公務預算、會計及決算、徵課會計、統計。
九、人事室：組織編制及任免遷調、考核獎懲、待遇福利。
十、政風室：政風查處、政風預防。
十一、大安分處：
第一股：地價稅、房屋稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、契稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：土地增值稅、使用牌照稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第四股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十二、中山分處：
第一股：地價稅、房屋稅、契稅、土地增值稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、契稅、土地增值稅、印花稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：地價稅、房屋稅、契稅、土地增值稅、印花稅、使用牌照稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第四股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十三、松山分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十四、信義分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十五、中正分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十六、萬華分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十七、大同分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十八、士林分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、印花稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第四股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
十九、北投分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
二十、內湖分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第四股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
二十一、南港分處：
第一股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、土地增值稅、契稅、使用牌照稅、娛樂稅等稽徵相關業務及欠稅清理。
第三股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理、電作管理。
二十二、文山分處：
第一股：地價稅、房屋稅、印花稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第二股：地價稅、房屋稅、契稅、印花稅、 娛樂稅等稽徵、及欠稅清理相關業務。
第三股：土地增值稅、印花稅、使用牌照稅等稽徵及欠稅清理相關業務。
第四股：全功能服務臺、轉帳納稅、為民服務、稅務管理、公文管理、人事總務管理及電作管理業務。
